外泌体中除了含有核内体来源蛋白（ESCRTs、TSG101等）、细胞内运输相关蛋白（Rab GTPase等）或细胞膜来源蛋白（CD63、CD81等）等分泌细胞来源蛋白外，还包含了分泌细胞的细胞膜和核内体膜来源的脂质（胆固醇、鞘磷脂等）。
多年来，外泌体一直被认为是将这些细胞内组分作为废物排出的一种机制，但近年的研究发现，外泌体是分泌细胞与靶细胞之间交换蛋白和脂质的重要媒介。免疫细胞来源的外泌体中含有抗原肽-MHC复合物和各种抗原，能够控制免疫细胞之间抗原信息的交换、免疫细胞的活化和抑制等多种免疫应答现象。
