外泌体内部是疏水性囊腔，囊腔内物质通称为“外泌体的内容物”【像牛肉丸里面的灌汤】，含有来自母细胞微环境和细胞质的多种蛋白、核酸、脂类和代谢物等。国际胞外囊泡数据库ExoCarta中收录的内容物包括：9769种蛋白质、3408种mRNA、2838种miRNA、1116种脂类等。
外泌体合成过程主要在细胞质内，RNAs在加工过程中进入外泌体内，且受到磷脂双层膜保护而维持稳定，因此外泌体中含有丰富的RNAs，包括mRNA、miRNA、piRNA、snoRNA、snRNA、rRNA、tRNA、Y-RNA和scRNA等。外泌体RNAs不仅仅是液体活检最有价值的信息分子，也是外泌体发挥细胞调控功能的重要效应分子。
