外泌体起源自细胞膜向内出芽(inward budding)形成胞内小体(endosome),在细胞内经过早期胞内小体、多囊复合体、定向组装、迁移等过程,与细胞膜融合后以外吐(exocytosis)方式排出细胞。因而成分和结构更为复杂,甚至包含部分从胞外间质或培养液中“吞入”的成分。外泌体大小约50-150nm,含有细胞膜常规的四跨膜蛋白(CD9、CD63、CD81等);热休克蛋白(Hsc70)、溶酶体蛋白(Lamp2b)、肿瘤敏感基因101(Tsg101)融合蛋白(CD9、flotillin,annexin)等蛋白,膜上胆固醇和二酰甘油含量较高。